Nació en Aranzazu (Caldas) el 31 de octubre de 1954. Desde temprana edad descubrió que en los libros estaba su proyecto de vida. Lector de todas las horas, a la edad de quince años escribió sus primeros cuentos, narraciones de misterio que nunca publicó, influenciadas por las lecturas que hasta entonces había hecho de Edgar Allan Poe. Tenía diecisiete años cuando vio por primera vez su nombre en letras de molde. José Restrepo Restrepo le publicó un artículo en las páginas editoriales de La Patria. Desde entonces no ha parado de escribir. El fruto de esta dedicación a la palabra está en nueve libros publicados y cinco inéditos. Miembro de número de la Academia Caldense de Historia, publica con regularidad textos históricos en la revista Impronta. Como conferencista ha recorrido todo Caldas hablando en los colegios sobre la historia del departamento y sobre literatura latinoamericana. A la edad de veinte años escribió una novela de amor que echó a la basura al darse cuenta de que no tenía calidad literaria. En el año 2001 obtuvo el Premio Departamental de Literatura de Caldas en el género cuento con el libro Sinfonía en azul. Fue finalista (Tercer puesto) en el Concurso Internacional de Cuento convocado por la Alcaldía de Aracataca para celebrar los noventa años del natalicio de Gabriel García Márquez. Escribe columnas de opinión en El Tiempo.com, en el periódico El Andino y en el portal Eje21.com. Publica ensayos sobre literatura en Papel Salmón de La Patria de Manizales y las revistas Las Artes del Diario del Otún de Pereira e Imágenes de La Opinión, de Cúcuta.
La pluma de José Miguel Alzate se ha paseado por las páginas de los más importantes pèriódicos colombianos. Como ensayista y crítico literario sus textos han visto la luz pública en medios como El Colombiano, La Opinión, Diario del Otún, La República, La Patria y El Heraldo. Revistas de circulación regional y local, como Eje XXI, Hipsipila, Impronta y Desarrollo Indoamericano, han publicado sus trabajos literarios y periodísticos. Es miembro de número de la Academia Caldense de Historia. Desde el año 2010 es columnista del diario El Tiempo. Es autor de la letra del pasodoble "Aranzazu, canción y poesía", con música del maestro Manuel Alvarado.
En "Sinfonía en azul" aparecen cuentos de corte social como "Monólogo de una prostituta", de temática infantil como "La estrella encantada", de tipo popular como "Monólogo de un culebrero", de contenido polìtico como "La muerte de Casimiro Trespuertas", de estilo romántico como "El olor de tu perfume" y de evocación de la infancia como "Sinfonía en azul". Sobre este libro escribió el novelista Fernando Soto Aparicio: "La angustia, la esperanza, la nostalgia, el amor que no se dá del todo; el odio, inevitable como el óxido del alma; el misterio de lo cotidiano; el remordimiento, que es como un perro que siempre ataca a traición; la fe perdida y recobrada, la confianza que renace para morir. Todo está dicho en estos cuentos, con los cuales José Miguel Alzate entra por la puerta grande de los narradores colombianos, a partir de ese semillero de creadores y de excelentes manejadores de la palabra que es el Gran Caldas".
LIBROS PUBLICADOS
Javier Arias Ramírez, un poeta de Caldas (1989)
Conceptos libres (1997)
Aranzazu: su historia y sus valores (2000)
Samaná en la historia (2001)
Sinfonía en azul (Cuentos)(2002)
El sabor de la nostalgia (2003)
Entre la soledad y la angustia (2013)
Para conocer a García Márquez (2015)
San Rafael de los Vientos(Novela)(2017)